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온라인 안심존 데이터 ?

온라인 안심존 : 보안이 보장된 온라인 네트워크를 통해 집, 연구실, 사무실 등 어디서나 접속하여 데이터에 접근하고 분석

입니다.
#헬스케어 의료

소아청소년 정신질환 진단 안저 이미지 데이터

소아청소년 정신질환 진단 안저 이미지 데이터 아이콘 이미지
  • 분야헬스케어
  • 구분 안심존(온라인)
  • 유형 이미지
구축년도 : 2022 갱신년월 : 2024-01 조회수 : 6,182 다운로드 : 31

※ 내국인만 데이터 신청이 가능합니다.

  • 데이터 변경이력

    데이터 변경이력
    버전 일자 변경내용 비고
    1.1 2024-01-19 데이터 최종 개방
    1.0 2023-07-26 데이터 개방(Beta Version)

    데이터 히스토리

    데이터 히스토리
    일자 변경내용 비고
    2024-03-19 산출물 전체 공개

    소개

    대표적인 소아청소년 정신질환인 자폐스펙트럼장애(Autism Spectrum Disorder: ASD), 주의력결핍과잉행동장애(Attention Deficit Hyperactivity Disorder: ADHD) 및 기타 정신질환[발달지연(Developmental delay: DD), 정서장애(Emotional disorder: ED)]을 진단받은 소아청소년과 정상발달을 보이는 소아청소년의 안저 이미지 데이터.

    구축목적

    ASD, ADHD와 같은 소아청소년 정신질환을 선별하고 진단을 보조하기 위한 바이오마커의 하나로서 소아청소년의 대규모 안저 이미지 및 임상 데이터를 구축함.
  • ● 데이터 구축 규모  
     - 원천 데이터
      1) 정상, ASD, ADHD, 기타 정신질환군의 안저 이미지 데이터 총 6,146건(양안 데이터, 일부 단안 포함)  
      2) 메타 데이터 3,202건(대상자 기준)
     
    - 라벨링 데이터
       1) json 파일: 6,146건
       2) png 파일: 1,038,674건(각 채널별 30도씩 회전한 이미지, 원본 이미지 1건당 169건) 

     
    ● 데이터 구축 규모  
    데이터 종류 원천데이터 라벨링 데이터 
    자료형태 이미지 텍스트 텍스트  이미지
    (dcm) (csv) (json) (png)
    데이터 규모 6,146건 3,202건 6,146건 1,038,674건

     

    ● 데이터 분포
    - 클래스별 분포 

    ● 데이터 분포- 클래스별 분포
    구분  구성비
    정상  31.70%
    ADHD 19.21%
    ASD 31.70%
    ETC 29.23%

    - 연령대별 분포 

    ● 데이터 분포- 연령대별 분포
    구분  구성비
    영유아(만 7세 미만) 27.70%
    학령기(만 7세 이상~13세 미만) 43.57%
    청소년 (만 13세 이상~21세 미만) 28.73%

     

  • 저작도구 설명서 및 저작도구 다운로드

    저작도구 설명서 다운로드 저작도구 다운로드
  • AI 모델 상세 설명서 다운로드

    AI 모델 상세 설명서 다운로드 AI 모델 다운로드

    ● 학습 모델
     학습모델은 최신 기술 동향 및 높은 성능 기준으로 4가지 후보군을 선정함.
      - VGG-19
      - ResNet50 (224x224 pretrained)  
      - ResNeXt50
      - EfficientNet_B7 (600x600 pretrained)

      구현한 모델 중 소아청소년 안저 이미지 기반 ASD, ADHD 분류에 가장 적합한 즉 성능치가 가장 높은 모델을 선정하였으며, 성능치가 유사할 경우 처리속도가 빠른 모델을 최종 선정하였음. 

    ● 학습 모델
    구분 내 용
    VGG-19
    (2014) 
    알고리즘 Ÿ VGG-19 
    선정사유 Ÿ 옥스포드 대학의 연구팀 VGG에 의해 개발된 모델로써, 2014년 이미지넷 이미지 인식 대회 (ILSVRC 대회)에서 준우승을 한 모델임. 19개의 층으로 구성되어 층이 깊어질수록 분류 에러가 감소하여 성능이 좋아짐을 확인함.

    Ÿ transfer learning 기법을 활용해서 안저 질환들을 93.5% 정확도로 분류했던 사전연구를 근거로 선정하게 되었음.

    VGG-19  (2014)

    [관련연구]
    Ÿ Das, A., at el (2019, July). Classification of retinal diseases using transfer learning approach. In 2019 International Conference on Communication and Electronics Systems (ICCES) (pp. 2080-2084). IEEE. (Epoch: 150, Learning rate[Ir]: 0.001, Accurarcy: 93.58%)
    ResNet-50(2015)/ ResNeXt50(2016) 알고리즘 Ÿ ResNet-50/ ResNeX50
    선정사유 Ÿ 50개 계층으로 구성된 컨벌루션 신경망으로, ImageNet 데이터베이스의 1백만 개가 넘는 영상에 대해 훈련된 신경망의 사전 훈련된 버전을 불러올 수 있는 특징을 가짐.
    Ÿ 자폐아이를 스크리닝하는데 사용되어 0.9 (ROC) 결과를 도출하며 본 연구의 목표와 가장 부합한 사전 연구이기에 선정하게 되었음.
    Ÿ ResNeXt50는 기존 ResNet50을 변형한 모델로 2016년 ILSVRC에서 2등을 달성하였음. 하나의 input을 여러 경로로 나누어 학습한 후 합칠 후 있도록 변형한 모델임. 
    ResNet-50/ ResNeX50
    [관련논문]
    Ÿ Lai, M., at el. (2020). A machine learning approach for retinal images analysis as an objective screening method for children with autism spectrum disorder. EClinicalMedicine, 28, 100588. 
    EfficientNet_B7 (2019) 알고리즘 Ÿ EfficientNet_B7 
    선정사유 Ÿ imagenet 분류와 전이학습을 통한 보통의 이미지 분류 모두에서 가장 높은 정확도에 도달한 효율적인 모델로써, MnasNet 모델을 확장하는 휴리스틱 방식을 도입함으로써 EfficientNet은 다양한 규모에서 효율성과 정확성의 좋은 조합을 나타내는 모델 제품군 (B0 ~ B7)을 제공함.
    Ÿ 다른 분류모델보다 적은 양의 데이터로 높은 정확도를 가지는 모델 비교결과가 나왔기에 선정하게 되었음. 
     
    [관련논문]
    Ÿ Tan, M., at el (2019, May). Efficientnet: Rethinking model scaling for convolutional neural networks. In International conference on machine learning (pp. 6105-6114). PMLR. (Accurarcy: 84.4%) 

      정상 vs. ASD 분류 모델의 경우 ResNet50와 ResNeXt50에서 가장 높은 성능을 보였으며 정상 vs. ADHD 분류모델의 경우 ResNeXt50와 EfficientNetB0에서 가장 높은 성능을 보였음. 

     
    정상 vs. AS 정상 vs. ADHD
    정상 vs. ASD 정상 vs. ADHD
    model_ channel_ is_pretrained auc model_ channel_ is_pretrained auc
    name name name name
    ResNet50 r Pretrained 0.999215 ResNeXt50 r Pretrained 0.9987446
    ResNeXt50 r Pretrained 0.998274 EfficientNetB0 redfree_gray Scratch 0.9984058
    ResNet50 gray Pretrained 0.996117 ResNet50 r Pretrained 0.9931053
    ResNeXt50 redfree_rgb Pretrained 0.995372 ResNeXt50 g Scratch 0.9911127
    0ResNet50 r Scratch 0.994627 ResNet50 b Pretrained 0.9906344
    ResNeXt50 gray Pretrained 0.993176 ResNeXt50 r Scratch 0.985573
    ResNet50 g Pretrained 0.993 ResNet50 gray Pretrained 0.9848955
    ResNeXt50 redfree_gray Pretrained 0.990274 ResNet50 redfree_rgb Pretrained 0.9848557
    ResNeXt50 g Pretrained 0.988901 ResNeXt50 redfree_rgb Pretrained 0.9808305
    ResNet50 redfree_rgb Pretrained 0.98843 ResNeXt50 b Pretrained 0.9781205

     

  • 데이터 성능 점수

    측정값 (%)
    기준값 (%)

    데이터 성능 지표

    데이터 성능 지표
    번호 측정항목 AI TASK 학습모델 지표명 기준값 점수 측정값 점수
    1 정상 vs ASD 분류 성능 Image Classification ResNeXt50 Accuracy 90 % 99.82 %
    2 정상 vs ADHD 분류 성능 Image Classification ResNeXt50 Accuracy 80 % 99.64 %
    3 Cup, Disc 탐지 성능 Object Detection YOLO v3 mAP@IoU 0.5 75 % 99.67 %

    ※ 데이터 성능 지표가 여러 개일 경우 각 항목을 클릭하면 해당 지표의 값이 그래프에 표기됩니다.

    ※ AI모델 평가 지표에 따라 측정값의 범위, 판단 기준이 달라질 수 있습니다. (ex. 오류율의 경우, 낮을수록 좋은 성능을 내는 것으로 평가됩니다)

  • 설명서 및 활용가이드 다운로드

    데이터 설명서 다운로드 구축활용가이드 다운로드

    ● 데이터 포맷
    - 안저 이미지 데이터 예시(dcm)
    안저 이미지 데이터 예시 dmc

    - 라벨링 데이터 구성

    - 라벨링 데이터 구성
    구분 No 속성명 속성 및 내용
    필수  1 info 데이터셋 정보 (중분류)
    필수  1-2 organization_code 데이터셋 수집(촬영) 기관
    필수  1-3 patient_id 데이터셋 환자 ID
    필수  1-4 class 데이터셋 클래스(레이블)
    필수  1-5 direction 데이터셋 안구 촬영 방향
    필수  1-6 annotations 라벨링 정보 (중분류)
    필수  1-7 bbox_cup 라벨링 Cup 바운딩박스 정보
    필수  1-8 x1 라벨링 Cup 바운딩박스 x1 좌표
    필수  1-9 y1 라벨링 Cup 바운딩박스 y1 좌표
    필수  1-10 x2 라벨링 Cup 바운딩박스 x2 좌표
    필수  1-11 y2 라벨링 Cup 바운딩박스 y2 좌표
    필수  4 bbox_disk 라벨링 Disk 바운딩박스 정보
    필수  4-1 x1 라벨링 Disk 바운딩박스 x1 좌표
    필수  4-2 y1 라벨링 Disk 바운딩박스 y1 좌표
    필수  4-3 x2 라벨링 Disk 바운딩박스 x2 좌표
    필수  4-4 y2 라벨링 Disk 바운딩박스 y2 좌표
    필수  5 cd_ratio 라벨링 Cup/Disk ratio 정보
    필수  5-1 vertical 라벨링 Cup/Disk ratio 수직 비율
    필수  5-2 horizontal 라벨링 Cup/Disk ratio 수평 비율
    필수  5-3 area 라벨링 Cup/Disk ratio 면적 비율
    필수  6 cd_margin 라벨링 Cup/Disk ratio 여백 정보
    필수  6-1 upper 라벨링 Cup/Disk ratio 상단 여백값
    필수  6-2 lower 라벨링 Cup/Disk ratio 하단 여백값
    필수  6-3 left 라벨링 Cup/Disk ratio 왼쪽 여백값
    필수  6-4 right 라벨링 Cup/Disk ratio 오른쪽 여백값
    필수  7 area_eye_ratio 라벨링 면적 대비 Cup/Disk 비율 정보
    필수  7-1 disk 라벨링 면적 대비 Disk 비율
    필수  7-2 cup 라벨링 면적 대비 Cup 비율
    필수  8 filename 데이터셋 파일명 정보
    필수  9 image_original 데이터셋 원본 파일 정보
    필수  9-1 filename 데이터셋 원본 파일명
    필수  10 image_600px_rgb 데이터셋 600px RGB 파일명 정보
    필수  10-1 filename_d0 데이터셋 600px RGB 파일명 (0도 회전)
    필수  10-2 filename_d30 데이터셋 600px RGB 파일명 (30도 회전)
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    필수  10-5 filename_d120 데이터셋 600px RGB 파일명 (120도 회전)
    필수  10-6 filename_d150 데이터셋 600px RGB 파일명 (150도 회전)
    필수  10-7 filename_d180 데이터셋 600px RGB 파일명 (180도 회전)
    필수  10-8 filename_d210 데이터셋 600px RGB 파일명 (210도 회전)
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    필수  10-12 filename_d330 데이터셋 600px RGB 파일명 (330도 회전)
    필수  11 image_600px_gray 데이터셋 600px 회색조 파일명 정보
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    필수  12 image_r 데이터셋 R 채널 파일명 정보
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    필수  13 image_g 데이터셋 G 채널 파일명 정보
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    필수  14 image_b 데이터셋 B 채널 파일명 정보
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    필수  18-11 filename_d300 데이터셋 G 채널 스트레칭 파일명 (300도 회전)
    필수  18-12 filename_d330 데이터셋 G 채널 스트레칭 파일명 (330도 회전)
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    필수  19-1 filename_d0 데이터셋 B 채널 스트레칭 파일명 (0도 회전)
    필수  19-2 filename_d30 데이터셋 B 채널 스트레칭 파일명 (30도 회전)
    필수  19-3 filename_d60 데이터셋 B 채널 스트레칭 파일명 (60도 회전)
    필수  19-4 filename_d90 데이터셋 B 채널 스트레칭 파일명 (90도 회전)
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    필수  19-8 filename_d210 데이터셋 B 채널 스트레칭 파일명 (210도 회전)
    필수  19-9 filename_d240 데이터셋 B 채널 스트레칭 파일명 (240도 회전)
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    필수  19-11 filename_d300 데이터셋 B 채널 스트레칭 파일명 (300도 회전)
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    필수  20-10 filename_d270 데이터셋 Redfree RGB 스트레칭 파일명 (270도 회전)
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    필수  21 image_redfree_gray_stretch 데이터셋 Redfree 회색조 스트레칭 파일명 정보
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    - 라벨링 데이터 예시(json)

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                "filename_d90": "1_0001_L_redfree_gray_d90_stretch.png",
                "filename_d120": "1_0001_L_redfree_gray_d120_stretch.png",
                "filename_d150": "1_0001_L_redfree_gray_d150_stretch.png",
                "filename_d180": "1_0001_L_redfree_gray_d180_stretch.png",
                "filename_d210": "1_0001_L_redfree_gray_d210_stretch.png",
                "filename_d240": "1_0001_L_redfree_gray_d240_stretch.png",
                "filename_d270": "1_0001_L_redfree_gray_d270_stretch.png",
                "filename_d300": "1_0001_L_redfree_gray_d300_stretch.png",
                "filename_d330": "1_0001_L_redfree_gray_d330_stretch.png"
            }
        }
    }

    - 메타 데이터 구성: 성별, 나이, 키, 몸무게, 신체질량지수(Body mass index) 등을 포함한 측정 데이터, 진단명 및 중증도 데이터

    - 메타 데이터 구성
    분류 No. 항목 타입 필수여부 범위 비고
    항목명 항목설명

    임상

    정보

    1 organization 수집기관 코드 number Y 01월 04일 1: 세브란스
    2: 은평성모
    3: 강북삼성
    4:강남세브란스
    2 data_code 데이터 코드 number Y 1  
    -1000
    3 gender 성별 String Y “M”, “F”  
    4 age 나이 number Y 01월 20일  
    5 class 구분 String Y “Normal”, “ASD”, “ADHD”, “ETC“  
    6 stature 키(cm) number N    
    7 weight 몸무게 number N    
    (kg)
    8 body mass index 신체질량지수 number N    
    9 diagnosis 진단명 String Y “Normal”, “ASD”, “ADHD”, “DD”, “ED“  
    10 severity 중증도 String N “mild”, “moderate”, “severe” normal 그룹 제외

    - 메타 데이터 예시(csv)

    - 메타 데이터 예시(csv)
    organization_code data_code gender age class stature weight body mass index diagnosis severity
    1 2 F 7 ADHD 124.9 23.5 15.06409 ADHD mild

     

  • 데이터셋 구축 담당자

    수행기관(주관) : 연세대학교 산학협력단
    수행기관(주관)
    책임자명 전화번호 대표이메일 담당업무
    하성지 02-2227-8242 [email protected] 데이터 수집 및 정제, AI학습, 사업총괄
    수행기관(참여)
    수행기관(참여)
    기관명 담당업무
    가톨릭대학교 산학협력단 데이터 수집
    ㈜ 루먼랩 데이터 가공
    삼성의료재단 데이터 수집
    ㈜ 에스에스엘 데이터 검수, 품질관리
    데이터 관련 문의처
    데이터 관련 문의처
    담당자명 전화번호 이메일
    하성지 02-2227-8242 [email protected]
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리눅스 OS 계열에서 다운로드 받으시길 권장하며 윈도우에서 파일 다운로드 시 wsl(리눅스용 윈도우 하위 시스템) 설치가 필요합니다.

※ 파일 병합 리눅스 명령어

find "폴더경로" -name "파일명.zip.part*" -print0 | sort -zt'.' -k2V | xargs -0 cat > "파일명.zip"

- 해당 명령어 실행 시, 실행 경로 위치에 병합 압축 파일이 생성됩니다.

- 병합된 파일 용량이 0일 경우, 제대로 병합이 되지 않은 상태이니 "폴더경로"가 제대로 입력되었는지 확인 부탁드립니다.

※ 데이터셋 소개 페이지에서 다운로드 버튼 클릭하여 승인이 필요합니다.