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온라인 안심존 데이터 ?

온라인 안심존 : 보안이 보장된 온라인 네트워크를 통해 집, 연구실, 사무실 등 어디서나 접속하여 데이터에 접근하고 분석

입니다.
#헬스케어 의료

NEW 족부족관절 체중부하 CT 데이터

족부족관절 체중부하 CT 데이터 아이콘 이미지
  • 분야헬스케어
  • 구분 안심존(온라인)
  • 유형 이미지
구축년도 : 2023 갱신년월 : 2024-10 조회수 : 1,220 다운로드 : 22

※ 내국인만 데이터 신청이 가능합니다.

  • 데이터 변경이력

    데이터 변경이력
    버전 일자 변경내용 비고
    1.1 2024-10-30 데이터 최종 개방
    1.0 2024-06-28 데이터 개방 Beta Version

    데이터 히스토리

    데이터 히스토리
    일자 변경내용 비고
    2024-06-28 산출물 공개 Beta Version

    소개

    - Weight bearingCT에서 얻어지는 영상 획득
    - Polygon 세그멘테이션 정보에서 골성 지표를 추출하여 뼈를 구분
    - Bounding box를 통한 족부 족관절 질환 구분
    - Key point(Poly line)을 통한 족부질환 예측 및 구분

    구축목적

    - 진단 보조 목적으로 발과 발목 병변을 구분하고 족부 및 족부 질환의 진단 보조가 가능한 AI model (SaMD)를 개발
  • - 질환별 통계현황 

    질환별 통계현황
    NO 질환분류 질환명
    1 족부질환 (40%) 평발 
    요족 
    무지 외반증
    2 족관절질환 (40%) 발목 관절염 
    거골 연골 병변 
    부주상골 증후군
    족근골 유합
    3 정상 (20%) 정상

     

    - 남/녀 및 연령별 비율

    남/녀 및 연령별 비율
    NO 연령대 비율
    1 0 ~ 20 세 25%
    2 20 ~40 세 25%
    3 40 ~ 60 세 25%
    4 60세 이상 25%

     

    - 데이터 통계 

    데이터 통계
    품질지표 검사항목 측정지표 정량목표 검사대상 검사 방법
    산출물 데이터 종류 내용
    다양성
    (통계)
    성별 분포 구성비 1:1 라벨링 데이터 이미지
    (dcm)
    인공지능 학습용 데이터 구축 시 정의한 분류체계(카테고리)를 기준으로 어노테이션 데이터에 포함된 클래스 정보를 추출하여 통계치 산출
    나이 분포 구성비 소아,청년 : 중장년, 노인 =3:7 라벨링 데이터 이미지
    (dcm)
    다양성
    (요건)
    질환별 분포 구성비 중첩률 구성비 라벨링 데이터 이미지
    (dcm)
    정상 20%
    족부 질환 40%
    발목 질환 40%
  • 저작도구 설명서 및 저작도구 다운로드

    저작도구 설명서 다운로드 저작도구 다운로드
  • AI 모델 상세 설명서 다운로드

    AI 모델 상세 설명서 다운로드 AI 모델 다운로드

    - AI 모델 1
      -  족부 및 족관절 뼈의 세부 위치를 파악하기 위한 골성 구조 데이터 2차원 세그멘테이션 모델 개발
      -  딥러닝 모델 학습

         - Tibia, Fibula, Talus, Midfoot, Calcaneus 등을 포함한 10종의 세그멘테이션 예측모델 개발
         - U-Net 기반의 모델에 원본 의료 이미지, 클래스별 세그멘테이션 데이터를 학습 데이터 셋으로 활용하며, 최종적으로 이미지를 넣었을 때 각 클래스별 세그멘테이션 값 출력
         - 의료 영상 데이터를 활용한 여러 세그멘테이션 Task에선 상대적으로 적은 데이터 셋으로도 좋은 성능을 내는 U-Net 기반의 모델이 활용되며 때문에 본 제안에선 U-Net을 Baseline 모델로 선정

    골성 구조 데이터 2차원 세그멘테이션 모델 이미지

      -  학습 모델 검증 및 평가
         - 성능 평가는 세그멘테이션 분야에서 주로 활용되는 IoU 기반 mAP(Mean Average Precision)를 평가지표로 선정
         - IoU는 객체 검출의 정확도를 평가하는 지표로서, 객체 감지에서 개별 객체에 대한 검출이 성공하였는지 결과를 0~1 사이로 평가되며 AP에 활용 가능
         - mAP는 정밀도(Precision)와 재현율(Recall)의 조합으로 이루어진 평균 정밀도(Average Precision)를 평균하여 계산
         - 객체 감지 작업에서는 모델이 이미지 내에서 객체의 위치를 예측하고, 그 예측 결과와 실제 객체의 위치 간의 정확도를 측정하는데, 이러한 정확도를 평가하는 지표로 사용

    골성 구조 데이터 2차원 세그멘테이션 모델 검증 및 평가 수식 이미지

     

    - AI 모델 2
      -  질환 진단 보조에 활용할 족부 각도 추정을 위한 랜드마크 포인트 데이터 예측 모델 개발
      -  딥러닝 모델 학습

         - 평발, 요족 등의 족부 질환과 발목 관절염등의 족관절 질환 진단과정에서, Talo-1st metatarsal angle 등 아래에 명시한 특정 각도들을 이용하여 이를 보조할 수 있음
         - 족부 각도 추정을 위해선 각도를 측정하는 기준인 랜드마크 포인트가 필요하며 이를 위해 각도 추정을 위한 랜드마크 포인트 예측 모델을 개발
         - 주요 병변들과 연관된 각도들(calcaneal pitch angle, Talo-1st metatarsal angle (TMA), Talo-calcaneal angle (TCA), Hindfoot alignment angle (HAA), Medial talar articular surface angle (MTASA) 등)을 추정하기 위한 랜드마크 포인트 예측 모델 개발
         - GU2Net 기반 모델에 원본 이미지, 랜드마크 포인트를 학습 데이터 셋으로 활용하며, 최종적으로 이미지를 넣었을 때 랜드마크 포인트를 출력하는 인공지능 모델 개발
         - 공개된 연구 중 제안하는 task와 완전히 동일한 데이터와 모델은 없으며 이에 따라 유사한 task를 수행하는 연구를 기준으로 모델을 선정
         - GU2Net은 U-Net기반의 모델로 최근 손, 폐, 머리 등의 Xray 데이터셋에서의 랜드마크 포인트 추정연구에서 좋은 성능을 내고 있어 해당 모델을 Baseline 모델로 선정

    랜드마크 포인트 데이터 예측 모델 이미지

     

      -  학습 모델 검증 및 평가
         - 모델을 통해 예측된 랜드마크 포인트의 정확도 평가를 위해 mAP(Mean Average Precision)을 활용하며, 정확도 기준은 2차원 관절인식 분야에서 주로 활용되는 OKS값을 기준으로 함
         - OKS는 랜드마크 포인트(Key Point)를 예측하기 위해 객체검출에서 사용된 IoU와 유사하지만 다른 지표이며, Ground Truth 객체와 예측된 객체 사이의 유사성을 측정하는 지표로 AP 계산 역시 가능
         - mAP는 정밀도(Precision)와 재현율(Recall)의 조합으로 이루어진 평균 정밀도(Average Precision)를 평균하여 계산
         - 객체 감지 작업에서는 모델이 이미지 내에서 객체의 위치를 예측하고, 그 예측 결과와 실제 객체의 위치 간의 정확도를 측정하는데, 이러한 정확도를 평가하는 지표로 사용

    랜드마크 포인트 데이터 예측 모델 검증 평가 수식 이미지
                                                             , 
    - AI 모델 3
      -  질환 진단 보조를 위해 병변 위치를 추정할 병변 위치 데이터 기반 경계 박스 예측 모델 개발
      -  딥러닝 모델 학습

         - 병변 위치 데이터를 이용한 병변 위치 추정 모델 개발
         - 거골 연골 병변, 무지외반증, 부주상골 증후군, 족근졸 유합 등의 병변 클래스와 이에 해당하는 경계박스를 예측하여 출력
         - YOLO 기반 모델에 원본 이미지와 각 병변 클래스에 해당하는 위치가 레이블링 된 데이터(경계박스 좌표(x,y,w,h),)를 학습 데이터 셋으로 활용
         - 빠른 속도와 안정적인 정확도를 보여, 다양한 도메인의 경계박스 추정 Task에서 많이 활용되는 YOLO 모델을 Baseline 모델로 선정

    병변 위치 데이터 기반 경계 박스 예측 모델 이미지

     

  • 설명서 및 활용가이드 다운로드

    데이터 설명서 다운로드 구축활용가이드 다운로드

    - 데이터 설명

    데이터 설명
    AI 모델 Task 어노테이션 방법 어노테이션 속성 속성 설명 라벨링 데이터 포맷
    족부족관절 2차원
    segmetation 모델 
    Polygon Segmentation bone 10개의 뼈 분할  json
    족부족관절 각도
    추정 모델 
    Line, Angle Talo-1st metatarsal angle 거골-제1중족골간 각도 : 평발, 요족 진단 json
    족부족관절 질환 병변
    위치 탐지 모델
    BBox Hallux valgus 무지외반증 유무 json
    Osteochondral lession of talus (OLT) 골연골병변 유무
    Prehallux syndrome 부주상골 유무
    Tarsal coalition 족근골 유합  유무

     

    - 데이터 예시

    데이터 예시
    데이터 예시-데이터 수집/정제 이미지

    데이터 예시-Bone segmentation 이미지

    데이터 수집/정제 Bone segmentation
    데이터 예시-질환 bounding box 이미지 데이터 예시-4 key-point angle 추정 이미지
    질환 bounding box 4 key-point angle 추정

     

    - 데이터 저장방법

    데이터 저장방법
    폴더 규칙
    데이터 저장방법- 폴더규칙 이미지 상위폴더 : (Cone-Beam CT)
      하위폴더 : (진단코드)
        하위폴더 : (기관코드-Case식별ID)
        - Case 임상 정보 파일 목록(json)
        - 각도 라벨링 정보 파일(json)
        - 영상 원천 데이터 파일(DICOM)
        - 영상 원천데이터 라벨링 파일(json)
         (2D Bone Segmentation 및 Bounding Box)
  • 데이터셋 구축 담당자

    수행기관(주관) : 가톨릭대학교 산학협력단
    수행기관(주관)
    책임자명 전화번호 대표이메일 담당업무
    정준용 02-2258-6254 [email protected] 데이터 수집, 추출 및 정제, 가공 및 검수, 주관 행정
    수행기관(참여)
    수행기관(참여)
    기관명 담당업무
    ㈜엠에이아이티 데이터가공 / 추출 및 정제 /
    계명대학교 산학협력단 데이터 수집 / 데이터 전처리 및 분류 / 교육 및 검수
    ㈜인피티트 헬스케어 저작도구제공 / 데이터 품질 관리
    ㈜어반데이터랩 데이터 품질 관리 / AI 모델 개발
    데이터 관련 문의처
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    담당자명 전화번호 이메일
    연창진 053-258-4773 [email protected]
    이시욱 053-258-5925 [email protected]
    AI모델 관련 문의처
    AI모델 관련 문의처
    담당자명 전화번호 이메일
    안치성 02-515-1152 [email protected]
    임정환 02-515-1152 [email protected]
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    김용석 02-2194-1621 [email protected]
    김한영 02-2194-1621 [email protected]
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  • 1. 기관생명윤리위원회(IRB) 심의 결과 통지서 [IRB 알아보기] [공용IRB 심의신청 가이드라인]
    2. 기관생명윤리위원회(IRB) 승인된 연구계획서
    3. 신청자 소속 증빙 서류 (재직증명서, 재학증명서, 근로계약서 등 택1)
    4. 안심존 이용 신청서 [다운로드]
    5. 보안서약서 [다운로드]
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리눅스 OS 계열에서 다운로드 받으시길 권장하며 윈도우에서 파일 다운로드 시 wsl(리눅스용 윈도우 하위 시스템) 설치가 필요합니다.

※ 파일 병합 리눅스 명령어

find "폴더경로" -name "파일명.zip.part*" -print0 | sort -zt'.' -k2V | xargs -0 cat > "파일명.zip"

- 해당 명령어 실행 시, 실행 경로 위치에 병합 압축 파일이 생성됩니다.

- 병합된 파일 용량이 0일 경우, 제대로 병합이 되지 않은 상태이니 "폴더경로"가 제대로 입력되었는지 확인 부탁드립니다.

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